肥胖患者的界标很难确定，这对于医师是一种挑战。骨关节炎、强直性脊柱炎、脊柱后侧凸、腰部手术史、退行性椎间盘疾病可能使腰椎穿刺较难完成。

　　对于有此类疾病的患者，可能需要请麻醉科医师或介入放射科医师会诊，以提高腰椎穿刺的成功率。腰椎穿刺的并发症包括脑疝、心肺功能受损、局部或牵涉痛、头痛、出血、感染、蛛网膜下表皮囊肿和CSF漏。最常见的并发症是头痛，其在腰穿后48小时内的发生率高达36.5%。头痛的原因是CSF从穿刺部位渗漏的速度超过CSF的生成速度。头痛发生率的增加与所用腰穿针的粗细有关。最严重的并发症是脑疝，如果颅腔与脊髓腔之间的压力差大，就有可能导致脑疝。

　　在腰椎穿刺过程中，这种压力差可增加，导致脑干疝形成。医师通过详细询问病史和神经系统体检，可以发现易发生脑疝的高危患者。如果医师对进行腰椎穿刺仍有顾虑，CT可能有帮助，但颅内压升高不一定都能被影像学检查发现。但是，不是所有的患者都需要接受CT检查，因为它可延误诊断和治疗。

　　有出血性素质的患者非常容易发生出血，出血可导致脊髓受压。关于凝血障碍程度与出血危险的关系，尚无绝对标准，所以医师必须根据临床情况进行判断。蛛网膜下表皮囊肿是因皮肤栓子进入蛛网膜下腔引起的，采用有针芯的穿刺针就可避免其发生。