我国医疗器械行业有下面几个发展方向：
1、随着市场的逐渐成熟，用户需求更加趋于理性。如果将医疗行业用户的IT采购划分为冲动型、印象型、理性化三种，那么经过几年的应用与发展，相关的流程与应用将成为用户关注的核心。而由于用户对业务流程与应用的考虑越来越多，用户的需求将更加趋于理性化。
2、医疗信息化外包，跨企业整合IT资源。
从国外先进的发展经验来看，医疗IT系统外包已经得到一定程度的应用，而国内这一市场也进入预热期。医疗IT外包，某种程度上可能推动IT资源更快地整合，推进IT应用。比如，为了实施远程医疗系统，政府、医院、研究机构、电信基础设备运营商、大型专业IT外包服务商、医疗业ISV等，有可能整合为一张网，共同推进医疗卫生事业的发展。
3、公共卫生领域信息化将在全国快速发展。2003年以后，公共卫生领域信息化的发展步伐加快；2005年以后，公共卫生领域信息化需求有加速释放的迹象；预计从2007年开始的未来5年中，中国不同地区公共卫生领域信息化的发展将进一步加速。
4、区域医疗信息化整合需求将到更多的释放。2006年底，国家科技部公布“区域协同医疗服务示范工程”重大项目课题承担单位名单时，已明确提出要汇聚多方力量，以“资源共享、长效服务、低成本、低风险”的建设理念，构建涵盖医疗、教育、行业管理、疾病报告及公众健康服务的信息服务平台。
在医疗行业改革进程中，如何充分整合医疗资源，更好地实现患者在社区医疗机构与大型医院之间的转诊成为一个关键，而区域医疗信息化整合解决方案将成为支撑其发展的一个关键。
5、更多厂商加入到医疗业IT市场的竞争行列。纵观中国医疗信息化市场，从1993年起步至今，经历了三个发展阶段。第一阶段是大批做HIS的独立软件开发商（ISV）蜂拥出现；第二阶段是在价格战和不成熟的市场中，大批ISV倒掉；第三阶段则是国外公司介入。
未来中国医疗行业IT市场的快速增长，将受到更多厂商的关注。国际厂商中，除了英特尔把数字医疗单拿出来，作为与数字企业、移动市场并列的行业市场外，其他如IBM、Oracle、思科等都成立了专业的医疗行业部门。
而国内也有一些厂商看到了这个巨大的市场，正在介入，比如方正收购在医疗行业方案提供方面排列五大的ISV众邦。最值得关注的是国外公司的进入，它们无疑会使医疗信息化市场的竞争态势变得更如火如荼。
6、IT应用范围逐渐拓展，更多新兴应用进入眼帘。HIS一统天下的格局终将被打破，也正在被打破。继PACS（医疗影像信息系统）快速发展后，USIS（超声信息系统）、PIS（病理信息系统）、CMS（成本核算系统）、PEIS（体检信息系统）等也在发展，未来在电子病历、社区医疗以及更大范围的健康管理方面，还会催生更多的应用。
在应用上，仍将继续一个三步曲的进程。第一步，计费系统和临床系统；第二步，电子病历、结构化系统，更利于查询；第三步，工作流引擎、主件开发、SOA架构，更灵活，可以再造流程。
行业性风险：1）经济衰退、削减财政支出可能抑制高端出口市场需求；2）人民币升值削弱中国制造产品的全球竞争力；3）医疗器械生产销售在各国都受到严格的监管，政策改变或显著提高制造企业成本；4）国外大型医疗器械企业加速进入中国市场，以及内资品牌的价格竞争或导致竞争加剧，压低行业利润率。
复星医药董事长陈启宇表示,医疗器械面临很好的发展机会,随着新医改的发展,医疗器械市场需求将会有较大提升。新成立的合资公司将合并运营双方在中国的医疗器械业务,完善从医疗器械研发、制造到国内外营销的产业链体系。而作为我国排名前列的深圳医疗器械行业,在新改革之下更是受益匪浅。