1.术前肠道清洁:为腹部手术、结直肠手术、内窥镜手术等提供最佳手术区域，从而降低手术后出现并发症的可能性，减小手术后缝合处细菌滋生造成感染的机会，还适合所有进行全身或脊椎麻醉的病人。

　　2.治疗便秘:便秘是肠道水疗最重要的适应症之一，医学家认为便秘乃百病之源。便秘可引起肛肠疾患、肠道功能紊乱、形成粪便溃疡、结肠癌（严重便秘者10%-15%发生结肠癌），诱发心、脑血管疾病，影响大脑功能。男性长期便秘易患帕金森氏症，女性痛经、阴道痉挛。研究证明乳腺癌的发病率与便秘有着相关关系。

　　3.结肠透析：利用结肠粘膜面积大、血流丰富、有半渗透的特征，进行安全、无创的全结肠透析，可清除血液毒素达到净化血液的目的。

　　4.预防肠癌：食物在肠道滞留时间过长，在肠道内被分解为致癌物，这些致癌物质使结肠发生结肠溃疡，结肠息肉及结肠肿瘤等，肠道水疗能加强肠道蠕动功能，促使粪便排出体外，因而减少了粪便中的致癌物质与肠道粘膜接触的时间，预防肠道癌症的发生。世界卫生组织关于人类癌症的三级预防机制的第一级就是要求健康人群每月定期清洗大肠1-2次，以清除肠壁上潜伏的不明致癌因子。

　　5.其他：配合药物做保留灌肠可治疗妇科炎症、肠道炎症、肠结核、肠梗阻、胰腺炎、痢疾、美尼尔综合征、胃肠功能紊乱、药物过敏反应、酸中毒、酒精中毒等多种疾病的治疗和辅助治疗。