医用空气净化器往往按照军用防毒面具的结构原理设计，它的核心滤材主要分两个部分，一是医用级HEPA滤芯，二是超量军用级活性炭滤层，这种结构设计和军用防毒面具滤毒罐中“滤烟层”和“防毒炭层”的结构设计完全一致，其发挥的作用和军用防毒面具的滤毒罐的作用也一样，此外，医用空气净化器也会使用波长为253.7紫外灯杀菌装置。