1.行政管理系统

　　在医院信息系统中，医院行政管理子系统涉及医院的各科室的行政管理，主要包括人事管理系统、财务管理系统、后勤管理系统、药库管理系统、医疗设备管理系统、门诊和手术及住院预约系统、病人住院管理系统等。

　　2.医疗管理系统

　　医疗管理系统主要是医院涉及的医疗业务方面的信息处理，主要包括门诊、急诊管理系统，病案管理系统，医疗统计查询系统，血库管理系统等。

　　3.决策支持系统

　　决策支持系统主要是有关医疗业务质量等方面的处理，包括医疗质量评价系统、医疗质量控制系统等。

　　4.其他各种辅助系统

　　除了以上的行政管理系统、医疗相关业务处理系统，还有其他的辅助系统，如医疗情报检索系统、医疗数据库系统等。