电流通过绝缘线圈产生脉冲磁场后垂直穿透头皮进入皮质来诱发运动电位及其他生理生化反应，从而对大脑功能进行调节。通过规律重复刺激能产生累积、长时程的效应，此外，在生理上，rTMS产生的反复感应电流可以促进脑组织的血液循环，促进脑细胞的发育，修复受损的脑细胞，改善脑功能，帮助儿童提高语言和运动能力。