全自动核酸纯化仪的工作原理基于核酸提取和纯化的一般原理，结合了自动化技术和特定的分离方法。以下是其主要原理：

细胞破碎：全自动核酸纯化仪使用适当的方法（如机械破碎、化学裂解等）破坏细胞膜，释放出细胞内的核酸。这一步骤通常通过加入裂解缓冲液和混匀操作来实现。

杂质去除：样品中可能存在各种杂质，如蛋白质、RNA、DNA降解酶等。全自动核酸纯化仪会通过离心、过滤等步骤去除这些杂质，以保证最终提取到的核酸质量纯净。

核酸结合：核酸纯化仪会使用特定的柱子、载体或磁珠等材料，这些材料具有亲和性，能够选择性地结合目标核酸。这一步骤通常涉及添加结合缓冲液和混匀操作，使核酸与载体发生结合。

洗脱纯化：非特异性结合的杂质会被洗脱掉，而目标核酸仍然与载体结合。全自动核酸纯化仪会使用适当的洗涤缓冲液进行洗脱步骤，以去除非特异性结合物质。

洗脱核酸：最后，核酸纯化仪会使用适当的缓冲液将目标核酸从载体或柱子上洗脱下来，得到纯净的核酸溶液。这一步骤通常通过加入洗脱缓冲液和离心操作来实现。

全自动核酸纯化仪通过自动化技术实现了以上步骤的高效、准确处理。它能够同时处理多个样品，并根据预设的程序和参数自动完成各个步骤，大大提高了核酸纯化的效率和一致性。不同型号的核酸纯化仪可能采用略有差异的具体方法和技术，但总体原理基本相似。