准备：确保角膜内皮显微镜处于良好工作状态，检查光源、镜头和接触镜的清洁度。

麻醉眼部：通常情况下，使用麻醉眼药水来麻醉眼部，以提供更舒适的检查过程。

定位接触镜：将透明接触镜放置在眼睛上方，对齐患者的角膜。使用眼科凝胶来帮助接触镜贴合在角膜上。确保接触镜不会过度压迫角膜，以免影响结果。

对焦和调整：通过显微镜调节目镜和物镜的焦距，以获得清晰的图像。根据需要，调整显微镜的放大倍率。

观察和记录：使用显微镜的目镜或者连接到计算机的显示器来观察角膜内皮细胞的图像。仔细检查细胞的形状、大小、排列密度以及任何异常的迹象。记录观察结果，可以使用图像采集和处理系统进行图像的存储和分析。

结束检查：在检查结束后，将接触镜从患者眼睛上取下。根据需要，清洁和消毒接触镜以备下一次使用。