样本处理系统：这一部分负责接受并处理来自患者的生物样本，如血液或尿液。它包括样本分配、稀释、混匀和分注等功能，确保样本能够被准确地送入分析系统。

分析系统：分析系统是整个仪器的核心部分，它采用各种先进的技术（如光学、电化学、免疫学等）对样本中的化学成分进行测量和分析。这些技术包括分光光度法、电化学法、酶标记法等，以确保高精度和可靠的测试结果。

试剂盒与试剂盒管理系统：全自动生化分析仪需要使用各种试剂来完成不同的生化指标检测。试剂盒管理系统负责存储、识别和使用这些试剂，确保在测试过程中能够准确地添加适量的试剂。

反应体系：这一部分提供了进行化学反应所需的环境条件，例如恒温、搅拌等，确保反应的稳定性和准确性。

数据处理与输出系统：全自动生化分析仪配备有数据处理系统，能够对测试结果进行处理、分析，并将结果输出到显示屏上或者通过打印机输出报告。同时，它也可以将数据存储在内部数据库中，以便后续查询和管理。