样本处理：首先，操作人员将待测样本装入样本架中，然后样本处理系统会对样本进行识别、分配、稀释和混匀等操作，以确保样本的准备工作完成。

自动分析：经过样本处理后，样本被送入分析系统。在分析系统内部，针对不同的生化指标，采用各种先进的检测技术（如光学、电化学、免疫学等）进行测量和分析。例如，对于血液中的葡萄糖含量，可能会采用光学检测技术；对于某些酶类物质，则可能采用酶标记法等。

试剂使用：根据需要，在分析过程中，试剂盒管理系统会自动识别并使用相应的试剂，确保在测试过程中能够准确地添加适量的试剂。

数据处理与输出：分析系统测得的数据会被传输到数据处理系统中进行处理和分析。最终结果可以通过显示屏展示或者通过打印机输出报告。同时，数据也会存储在内部数据库中，以便后续查询和管理。

质控：在整个过程中，全自动生化分析仪会进行内部的质控程序，确保测试结果的准确性和可靠性。