样本处理系统：用于接受待测样本，可能包括自动进样器或者手动操作的样本加入口。这一部分通常还包括混匀器或搅拌器，以确保样本均匀混合。

试剂盒舱：用于存放不同类型的试剂盒，每种试剂盒对应特定的分析项目。这些试剂盒内含有必要的试剂和标记物。

光源和检测系统：包括激发光源和检测器。激发光源通常是特定波长的光源，用于激发样本中的荧光标记物。检测器则用于测量样本中产生的荧光信号。

控制系统：用于控制仪器的运行，包括设置分析参数、启动分析程序、数据记录等功能。这一部分可能包括触摸屏或者其他用户界面。

计算机系统：用于数据处理、结果分析和输出。通常包括预装的分析软件，可以根据需要生成报告或者导出数据。

试剂盒排放系统：用于安全处理使用过的试剂盒，避免交叉污染。