评估角膜健康： 角膜内皮细胞显微镜可用于评估角膜的健康状况，包括观察细胞密度、形态和排列情况，从而帮助医生判断角膜是否受损或发生疾病。

角膜手术前评估： 在进行角膜手术（如屈光手术、角膜移植等）前，角膜内皮细胞显微镜可用于评估患者的角膜内皮细胞情况，以确定手术的适宜性和风险。

监测角膜疾病进展： 对于一些慢性角膜疾病，如角膜内皮细胞失代偿性损伤、角膜水肿等，角膜内皮细胞显微镜可用于监测病情的进展和治疗效果。

评估角膜移植术后情况： 在角膜移植手术后，角膜内皮细胞显微镜可用于评估移植角膜内皮细胞的恢复情况，以及监测移植术后的并发症，如排斥反应等。

诊断眼部疾病： 角膜内皮细胞显微镜还可用于辅助诊断一些眼部疾病，如角膜内皮细胞病变、角膜炎症等，为医生提供诊断依据。