疾病诊断与监测：全自动生化免疫分析仪可以用于检测血清、尿液等样本中的生化指标（如血糖、肝功能指标、肾功能指标等）和免疫指标（如抗体、抗原等），帮助医生诊断和监测各种疾病，如糖尿病、肝炎、肾病、心血管疾病等。

药物治疗监测：全自动生化免疫分析仪可以监测患者在药物治疗过程中的生化参数变化，帮助医生调整药物剂量、选择合适的药物，确保治疗效果和减少药物副作用。

急诊诊断：在急诊科，全自动生化免疫分析仪可以快速、准确地检测患者的生化和免疫指标，为医生提供及时的诊断依据，帮助制定救治方案。

健康体检：在健康体检中，全自动生化免疫分析仪可以对体检者的生化和免疫指标进行全面检测，评估个体的健康状况，提供个性化的健康管理建议。

疾病筛查：全自动生化免疫分析仪可以用于大规模的疾病筛查项目，如乙肝病毒、艾滋病病毒等的筛查，帮助早期发现患者，进行干预和治疗。

科研支持：全自动生化免疫分析仪在临床研究和科研中也扮演着重要角色，可以用于研究各种疾病的生化和免疫指标变化，探索疾病的发病机制和治疗方法。