妇科疾病：微波治疗机常用于治疗宫颈糜烂、宫颈炎、阴道炎、盆腔炎等妇科疾病。通过微波的热效应，可以促进局部血液循环，加速炎症吸收，达到治疗目的。

皮肤科疾病：微波治疗机可用于治疗皮肤溃疡、疣、痣、疤痕、痤疮等皮肤病变。微波能够促进局部组织的新陈代谢，加速伤口愈合。

口腔科疾病：在口腔科，微波治疗机可以用于治疗牙周炎、口腔溃疡等。微波的热效应有助于减轻疼痛，促进炎症消退。

耳鼻喉科疾病：微波治疗机可用于治疗慢性咽炎、扁桃体炎、鼻炎等。微波能够改善局部血液循环，减轻炎症症状。

肛肠科疾病：微波治疗机在肛肠科主要用于治疗痔疮、肛裂、肛周脓肿等。微波的热效应有助于止血、消炎、促进伤口愈合。

康复理疗：在康复理疗科，微波治疗机可用于治疗肌肉疼痛、关节炎、神经痛等。微波的非热效应能够改善局部血液循环，缓解疼痛。

泌尿外科：微波治疗机在泌尿外科可用于治疗前列腺炎、前列腺增生等。微波的热效应有助于改善局部血液循环，减轻炎症。

肿瘤治疗：微波治疗机还可用于肿瘤的热疗，通过微波加热使肿瘤组织温度升高，达到破坏肿瘤细胞的目的。