电源：电泳仪的电源用于建立电泳电场，是电泳仪的核心部件之一。电源可以分为普通直流电源、直流稳压电源、直流稳流电源、双稳电源和三恒电源等，它们在输出电压、电流的稳定性以及功率输出上有所区别。

电泳槽：电泳槽是样品分离的场所，是电泳仪的主要部件。槽内装有电极、缓冲液槽、电泳介质支架等。电泳槽的种类很多，按电泳的形式可分为自由界面电泳槽、管状电泳槽以及板状电泳槽。

恒温循环冷却装置：提供循环冷却水，可将电泳槽的冷却板温度控制在一定范围内，以保持电泳过程中的温度稳定。

伏时积分器：用于记录电泳过程中的电压和时间，以确保电泳条件的一致性。

凝胶烘干器：用于电泳后的凝胶干燥，便于后续的染色和分析。

分析检测装置：包括染色和扫描等检测单元，用于对电泳后的样品进行分析和检测。扫描或检测设备可分为可见光源、紫外光、荧光和激光光源等，通过扫描电泳条带，可得出各组分的相对百分比或绘制曲线图。

高压电泳仪：对于毛细管电泳，需要施加高电场强度与高电压，因此使用的电泳仪是一种超高压电器装置，应具备良好的绝缘性和稳定的输出功率。

毛细管柱：毛细管电泳仪的核心部件，一般是圆管型的，具有化学惰性、电惰性、紫外及可见光透过性等特性，并且有一定的柔韧性。