超声药物穴位透入仪的潜在风险与局限性主要体现在以下几个方面：

个体差异与设备使用：不同患者对超声波的反应可能存在差异，需要个体化调整治疗方案。此外，设备的正确使用和维护对治疗效果至关重要，需要专业培训和指导。

交叉感染风险：治疗过程中需注意避免交叉感染的风险，确保治疗探头等耗材的一次性使用或严格消毒。

操作复杂性与普及性：超声透药仪设备昂贵，难以普及到普通家庭，且操作复杂，对普通患者来说可能难以负担。

皮肤刺激与副作用：虽然超声透药仪在提高药物吸收和减少副作用方面有一定优势，但部分研究显示，超声波可能引起皮肤刺激或不适感，且在某些情况下可能出现副作用，如恶心、嗜睡等。

治疗深度与时间限制：超声药物透入治疗仪的透入深度受限，治疗时间较长，可能影响治疗效果和患者依从性。

禁忌症与适用范围：超声透药仪适用于某些特定治疗范围，但存在一些禁忌症，如皮肤破损、急性化脓性炎症、出血倾向部位禁用等。

技术局限性：尽管超声透药技术在促进药物渗透方面具有优势，但其在药物输送效率、设备控制和长期安全性等方面仍存在局限性，需要进一步研究和优化。

超声药物穴位透入仪在提高药物吸收和治疗效果方面具有潜力，但其应用仍面临个体差异、操作复杂性、副作用和设备普及性等方面的挑战。