艾康高温高压灭菌器的工作原理基于湿热灭菌（Moist Heat Sterilization）的物理机制，即利用饱和水蒸气在密闭腔室内形成的高温高压环境，使微生物的蛋白质发生不可逆变性、凝固，同时破坏其核酸结构与细胞膜完整性，从而实现彻底灭菌。根据热力学原理，当腔室内压力升高时，水的沸点随之上升，使得蒸汽温度可超过常压下的100℃。例如，在标准灭菌参数121℃下，对应表压约为103 kPa（15 psi）；若采用134℃快速灭菌程序，则需维持约205 kPa（30 psi）的压力。艾康设备通过电加热系统将去离子水或蒸馏水加热汽化，生成饱和蒸汽，经由腔体底部或侧壁的蒸汽分布系统均匀导入灭菌室，确保热能传递无死角。

灭菌过程通常分为三个阶段：预真空/排气阶段、灭菌阶段和干燥/排气阶段。在预处理阶段，设备通过重力置换或脉动真空方式排除腔内冷空气，因为空气的存在会形成“冷点”，阻碍蒸汽渗透，降低灭菌效率。艾康部分高端型号配备真空泵，支持三次以上脉动抽真空，显著提升空气排除率。进入灭菌阶段后，控制系统精确维持设定温度与时间（如121℃持续15–30分钟，或134℃持续3–10分钟），期间温度传感器与压力传感器实时反馈数据，由微处理器进行闭环调节。灭菌结束后，进入干燥阶段，通过缓慢降压并启动风机或真空辅助，去除器械表面残留水分，防止二次污染。整个过程符合《WS 310.2-2016 医院消毒供应中心 第2部分：清洗消毒及灭菌技术操作规范》对湿热灭菌的流程要求。