艾康免疫分析系统依据型号差异在结构上有所区别，但典型全自动化学发光平台（如iFlash 3000）通常由以下核心模块构成：样本处理单元、试剂冷藏与分配单元、反应盘/杯装载区、温控孵育模块、磁分离清洗站、化学发光检测器、控制系统及数据管理软件。样本处理单元包含条码扫描器、样本架轨道及高精度机械臂，可自动识别样本管并完成穿刺取样，支持原始管直接上机，减少人工干预。试剂单元配备4–8℃恒温冷藏舱，可容纳数十种试剂盒，每种试剂通过独立蠕动泵或压电式移液器精确分配，避免交叉污染。

反应模块采用一次性塑料反应杯或可重复使用的磁珠反应盘，置于恒温（通常37±0.5℃）孵育区，确保免疫反应在最佳动力学条件下进行。磁分离清洗站利用高梯度磁场将磁珠固定，同时通过多通道喷淋系统完成3–5次缓冲液清洗，有效去除未结合物质，降低背景噪声。光学检测模块由暗室、PMT或CCD传感器、滤光片组及信号放大电路组成，具备自动增益调节和暗电流补偿功能，以维持长期检测稳定性。整机由嵌入式工业计算机控制，运行基于Windows或Linux的专用LIS（实验室信息系统）接口软件，支持双向通信、自动审核、质控图绘制及电子报告生成。

对于便携式荧光免疫分析仪（如Fluorecare® F1000），结构则高度集成化：主机尺寸通常小于30×20×15 cm，内置锂电池、微型泵、LED光源、滤光片、CMOS图像传感器及触摸屏，整机重量约2–3 kg，便于床旁或现场使用。所有关键部件均通过ISO 13485质量管理体系认证，并符合YY/T 0287-2017（等同于ISO 13485:2016）对医疗器械设计开发的全过程控制要求。