正如人们知道的用高压水枪能够容易地冲洗干净汽车等，适当压力的水流早已被证明能有效地清洁人们的牙齿和口腔. 冲牙器的清洁作用主要是利用在一定压力下喷射出来的高速水柱的冲击力来实现的.

2）直接利用自来水的压力. 所以冲牙器按结构可主要分为电动冲牙器和水龙头冲牙器两大类. 电动冲牙器的结构主要有一个电动水泵，储水槽，喷头. 水龙头冲牙器的结构主要有一个与水龙头的连接装置和喷头.

牙齿与牙龈交界处有一个约2毫米深的围绕牙齿但没有附着在牙齿的沟叫牙龈沟. 这是通向牙齿根基的最重要交界处但却最易藏污纳垢，是最容易引起牙齿及牙龈疾病的地方. 牙龈沟和牙缝是两个最不易清洁的地方，有研究指出“有多达40%的牙齿表面无法用牙刷清洁”. 虽然用牙线（或牙签）能够清除牙齿表面堆积物，但微观上看，凸凹不平的牙齿表面仍然会不清洁.细菌生长只需极薄的一层营养膜即可，残存的脏物膜的有害作用也仍然部分存在. 既有摧枯拉朽的强力又能钻缝入孔的压力水流从原理上讲是最理想的口腔清洁方式. 据美国有关机构研究，压力水柱能冲进牙龈沟冲洗到50-90%的深度. 压力水柱不仅能清洁到各种缝隙孔洞和凸凹崎面，而且其效果可以达到微观的彻底”清洁”而不只是宏观的粗略”清除”. 冲牙器除有清洁牙齿口腔的功能外，水流对牙龈还有按摩作用，促进牙龈的血液循环增强局部组织抗病力； 同时还能消除因口腔卫生差产生的口臭.