大脑生物反馈治疗仪的治疗原理是:刺激信息引起感知觉进入大脑,经过大脑处理,传入电脑时经过特殊软件的同步处理,又进一步引发刺激信息的变化,再引发大脑的变化,如此循环往复。大脑生物反馈与一般生物反馈不同的是本仪器的最终效应器官不是血管或内脏，而是大脑电生理活动自身，正是经过治疗调整了大脑的功能。