血液采集：医用打孔器常用于静脉或动脉血液采集。它们可以用于采集血液样本进行常规血液检查、血型鉴定、感染标记物检测等。

组织穿刺和活检：医用打孔器可用于组织穿刺和活检，以获得组织样本进行病理学分析和诊断。例如，在肿瘤学中，穿刺活检可用于获取肿瘤组织样本进行病理学检查和基因分析。

体腔积液采集：医用打孔器可用于穿刺胸腔、腹腔或其他体腔，以采集积液样本进行分析。这对于诊断和治疗涉及体腔积液的疾病，如胸腔积液、腹水等，具有重要意义。

导管置入：医用打孔器可用于引导导管进入体内。例如，在血管介入手术中，导丝和导管可以通过使用导向穿刺针和导管打孔器来引导进入血管系统。

腔道建立：医用打孔器可用于建立腔道，以便进行手术操作或引导其他器械进入体腔。例如，在胸腔闭式引流术中，打孔器用于建立胸腔引流管的通道。

其他应用：医用打孔器还可以用于其他一些特定的临床操作，如骨髓穿刺、脑脊液采集等。