准备工作：首先，需要准备好分选所需的细胞样本。样本可以是细胞悬液、组织细胞悬液或血液等，根据实验设计选择合适的样本和预处理方法。确保样本的质量和纯度对于分选结果的准确性至关重要。

仪器设置：根据实验要求，进行细胞分选仪的仪器设置。这包括设置流体流速、光源灯、激光器、荧光探测器等。根据目标细胞类型，确定要检测和分选的荧光标记和参数设置。

调整仪器和校准：需要对仪器进行调整和校准，以确保精确的细胞分选。这包括流量校准、荧光参数校准、检测器灵敏度等的调整。校准确保流式细胞仪可以准确地识别和分选目标细胞。

样本加载与分选：将样本装载到细胞分选仪的样本室中。根据实验要求和目标细胞类型，设置筛选门和排序参数。启动仪器后，样本开始通过流式细胞仪的流道，通过荧光激发和检测系统，根据预设的参数进行细胞分选。

数据获取与分析：细胞分选仪会同时提供分选和检测的数据。获取后续分析所需的数据（如细胞计数、分布等），以及用于后续实验的已分选细胞。

清洗和维护：在完成细胞分选后，对细胞分选仪进行清洗和维护工作，以确保设备的正常运行和准确性。