来源与生产方式：传统胶原蛋白主要来源于动物组织（如牛、猪、鱼等），通过提取和处理获得，而重组胶原蛋白则是通过基因工程技术在微生物或植物细胞中合成，利用DNA重组技术制备，具有更高的可控性和纯度。

安全性与免疫反应：传统胶原蛋白可能因动物源性成分引发排异反应、过敏反应或病毒隐患，而重组胶原蛋白由于其基因序列与人体胶原蛋白高度一致，具有更好的生物相容性和更低的免疫原性，安全性更高。

分子结构与功效：传统胶原蛋白分子量较大（约150-250 kDa），而重组胶原蛋白分子量较小（500-5000 Da），更易被皮肤吸收，透皮吸收性更好，修复和抗衰老效果更佳。

生产与质量控制：重组胶原蛋白通过基因工程技术可实现分子量和结构的精确控制，质量更稳定，批次间一致性高，而传统胶原蛋白生产过程复杂，质量控制难度较大。

应用领域：重组胶原蛋白在医疗、美容、护肤品等领域应用更广泛，尤其在高端护肤品和医疗美容产品中更具优势。

重组胶原蛋白在安全性、功效、可控性和应用范围等方面均优于传统胶原蛋白，是当前胶原蛋白领域的技术发展方向。