编号

名称

规格

单位

服务厂家

备注

1

引物合成 --2OD

ULTRPAGE级***D

bP

上海生工

2

引物合成 --5OD

ULTRPAGE级***D

bP

3

兼并碱基 Ⅰ合成--2OD

ULTRPAGE级***D

bP

上海生工

4

兼并碱基 Ⅰ合成--5OD

ULTRPAGE级***D

bP

5

探针标记 --2OD

ULTRPAGE级***D

条

6

探针标记 --5OD

ULTRPAGE级***D

条

上海生工或指定厂家

7

亚克隆

上海生工或指定厂家

8

序列测定

***BP/反应

反应

昆泰锐或指定厂家

9

毛细管电泳测序

***孔/板

板

上海生工或指定厂家

***

细菌全基因组测序

测序深度 ***X以上，Q***值大于***%

株

诺禾

文库构建 +上机测序

***

细菌全基因组测序（拼接）

测序深度 ***X以上，Q***值大于***%

株

诺禾

文库构建 +上机测序+完整基因组拼接

***

HIV-1病毒耐药一代测序

***BP/反应

反应

1、接受中国疾控中心考核，成绩为优秀的测序公司；2、与中国CDC有耐药检测项目业务的专业测序公司

测序公司：北京诺赛基因或研究人员指定厂家

***

HIV-1病毒耐药检测服务

病例

个

1、接受中国疾控中心考核，成绩为优秀的测序公司；2、与中国CDC有耐药检测项目业务的专业测序公司

测序公司：北京诺赛基因或研究人员指定厂家

***

二代深度测序

培养物标本： 1、二代illumina NovaSeq/HiseqX Ten平台，要求PE***双端测序，PCR free建库、测序、生信分析和最终的分析报告（报告内容根据客户需求而定）；2、Q***≥***%,测序深度大于***X，样本组装的基因组覆盖率超过***%

株

与在研人员协商，共同指定测序公司

测序公司：上海伯杰医疗科技有限公司或研究人员指定厂家

***

二代深度测序

临床标本： 1、二代illumina NovaSeq/HiseqX Ten平台，要求PE***双端测序，PCR free建库、测序、生信分析和最终的分析报告（报告内容根据客户需求而定）；2、Q***≥***%,测序深度大于***X，样本组装的基因组覆盖率超过***%

份

与在研人员协商，共同指定测序公司

此价格为一份样品测一次序列的价格。测序公司：上海伯杰医疗科技有限公司或研究人员指定厂家

***

三代深度测序

临床标本： 1、Pacbio sequel平台，样本需要分析甲基化情况，单分子全长测序，要求PCR free建库、测序、生信分析和最终的分析报告。

份

与在研人员协商，共同指定测序公司

研究人员指定厂家

***

流感毒株一代测序

1个片断全序（至少测序8个反应）

株

与在研人员协商，共同指定测序公司

测序公司：上海伯杰医疗科技有限公司或研究人员指定厂家

***

流感毒株一代测序

8个片段全序（每个片段至少测序8个反应）

株

与在研人员协商，共同指定测序公司

测序公司：上海伯杰医疗科技有限公司或研究人员指定厂家

***

RNA病毒宏基因组测序

1.样品类型：拭子 ，粪便、唾液、血液、肠道内容物等样品。2测序类型：高通量二代测序（包含：病毒RNA提取、建库、测序、数据分析全流程。）3.数据量:6G    4：数据分析：a、数据质控（低质量reads过滤、adaptor过滤、宿主过滤） b 、基因组组装。 c、基因预测、去冗余。d、基因丰度统计：样本基因数目统计、core-pan基因稀释曲线、基因数目差异分析（组间基因数目差异箱图、Venn图/花瓣图）、基因数目的样品间相关性分析。e、物种注释及统计：物种丰度概况、注释基因数目及相对丰度聚类分析、基于物种丰度的降维分析、基于物种丰度的Bray-Curtis距离的降维分析、基于物种丰度的Anosim分析、基于物种丰度的样品聚类分析、组间差异物种的 Metastat分析、组间差异物种的LEfSe分析、随机森林分析，f、功能注释及统计：KEGG、eggNOG、CAZy。g、功能丰度统计：功能相对丰度概况、功能相对丰度聚类分析、基于功能丰度的降维分析、基于功能丰度的Bray-Curtis距离的降维分析、基于功能丰度的Anosim分析、基于功能丰度的样品聚类分析。g、代谢通路比较分析：代谢通路比较分析、代谢通路注释基因数目及差异EC分析。h、组间功能差异的Metastat分析、组间功能差异的LEfSe分析。i、抗性基因注释：抗性基因丰度概况、抗性基因类型的分布及丰度聚类分析、组间抗性基因数目差异分析、抗性基因与物种归属关系利用高通量测序技术得到病毒核酸的片段序列，通过后续生物信息分析，研究病毒的物种分布、相对丰度，以及预测新病毒。

份

伯杰

***

DNA病毒宏基因组测序

1.样品类型：拭子、粪便、唾液、血液、肠道内容物等样品。2测序类型：高通量二代测序（包含：病毒DNA提取、建库、测序、数据分析全流程。）3.数据量 ***G 4：数据分析：a、数据质控（低质量reads过滤、adaptor过滤、宿主过滤） b 、基因组组装。 c、基因预测、去冗余。d、基因丰度统计：样本基因数目统计、core-pan基因稀释曲线、基因数目差异分析（组间基因数目差异箱图、Venn图/花瓣图）、基因数目的样品间相关性分析。e、物种注释及统计：物种丰度概况、注释基因数目及相对丰度聚类分析、基于物种丰度的降维分析、基于物种丰度的Bray-Curtis距离的降维分析、基于物种丰度的Anosim分析、基于物种丰度的样品聚类分析、组间差异物种的 Metastat分析、组间差异物种的LEfSe分析、随机森林分析，f、功能注释及统计：KEGG、eggNOG、CAZy。g、功能丰度统计：功能相对丰度概况、功能相对丰度聚类分析、基于功能丰度的降维分析、基于功能丰度的Bray-Curtis距离的降维分析、基于功能丰度的Anosim分析、基于功能丰度的样品聚类分析。g、代谢通路比较分析：代谢通路比较分析、代谢通路注释基因数目及差异EC分析。h、组间功能差异的Metastat分析、组间功能差异的LEfSe分析。i、抗性基因注释：抗性基因丰度概况、抗性基因类型的分布及丰度聚类分析、组间抗性基因数目差异分析、抗性基因与物种归属关系利用高通量测序技术得到病毒核酸的片段序列，通过后续生物信息分析，研究病毒的物种分布、相对丰度，以及预测新病毒。

份

伯杰

***

细菌宏基因组测序

1.样品类型：拭子 、粪便、唾液、血液、肠道内容物等样品。2测序类型：高通量二代测序（包含：细菌DNA提取、建库、测序、数据分析全流程。）3.数据量 ***G 4：数据分析：原始数据+高质量数据+基于非拼接序列的物种注释+ 序列拼接+基于拼接序列的物种注释+基因预测+蛋白功能注释+物种组成谱分析+功能水平分析

伯杰

***

转录组测序

1.样品类型 组织、细胞等。2测序类型：高通量二代测序（包含：病毒DNA提取、建库、测序、数据分析全流程。）3.数据量 6G 4：数据分析：细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有mRNA转录组测序能够全面解析mRNA信息，同时获得样本的转录本结构和转录丰度信息探究疾病相关基因结构变异挖掘差异表达基因分析致病机制，从整体水平研究基因表达量以及基因结构，揭示特定生物学过程中的分子机理.

用户指定

***

呼吸道病原微生物靶向高通量基因检测

1.样品类型：拭子 ，粪便、唾液、血液、肠道内容物等样品。2.鉴定内容：鉴定临床常见的***种病原微生物、耐药基因、毒力基因包括：革兰氏阳性菌***种、革兰氏阴性菌***种、DNA病毒***种、RNA病毒***种、真菌***种、其他病原体（支原体、衣原体等 ）***种、耐药基因***种、毒力基因***种。3、检测方式：靶向高通量测序

华大

***

呼吸道病原微生物靶向高通量基因检测

1.样品类型：拭子 ，粪便、唾液、血液、肠道内容物等样品。2.鉴定内容：鉴定临床常见的***种病原微生物、***种耐药基因：革兰氏阳性菌***种、革兰氏阴性菌***种、DNA病毒***种、RNA病毒***种、真菌***种、分枝杆菌***种、支原体/衣原体/寄生虫 ***种、耐药基因***种。3、检测方式：靶向高通量测序。4数据分析：a、提供原始测序数据。b、病原种类鉴定。c、病原丰度计算。d、耐药基因鉴定

伯杰

***

蛋白质质谱

采用 4D-DIA基于timsTOFPro离子淌度平台的4D-DIA技术，上机时间不低于***分钟。提供差异蛋白功能分析，GO富集、KEGG富集、蛋白互作网络、GSEA富集等分析。

客户指定厂家

***

扩增子测序

使用 Illumina Novaseq 主流高通量测序平台进行 PE*** 测序；单样本测序数据量（raw tags）为 5 万条，单样本交付数据量不少于承诺数据量的 ***％，要求原始数据 Q***＞***%。QIIME2 流程，物种注释（OTU 聚类及物种注释概况）、物种分布情况（相对丰度、分类树、热图等）、样本复杂度分析(Alpha Diversity、物种多样性曲线等)、多样本比较分析(Beta Diversity、矩阵热图、降维分析等)、统计检验（组间差异分析、组间群落结构差异显著性检验（Anosim、 MRPP、 Adonis、 Amova）组间差异物种分析）、关联分析与模型预测（环境因子关联分析、 Network 分析、随机森林）功能预测（PICRUST、 Tax4fun、 FAPROTAX、 FunGuild、 BugBase 分析）

份

客户指定厂家

新增，以议标价格为准

***

宏基因组测序（ DNA+RNA）

1.样品类型：拭子 、粪便、肺泡灌洗液、血液、脑脊液等样品。2测序类型：高通量二代测序（包含：DNA+RNA提取、建库、测序、数据分析全流程。）3.数据量≥ ***G。 5：数据分析：原始数据+高质量数据+基于非拼接序列的物种注释+ 序列拼接+基于拼接序列的物种注释+基因预测+蛋白功能注释+物种组成谱分析+功能水平分析

份

客户指定厂家

新增，以议标价格为准

***

低丰度蛋白组测序分析

采用 dirECT DIA的定量分析，Astral平台。1鉴定通量（***）种蛋白。数据分析包括（多肽鉴定，pca分析，go分析，kegg分析，venn分析，火山图分析，PPI蛋白互作，亚细胞定位，生物标志物筛选

份

客户指定厂家

新增，以议标价格为准

***

非靶代谢组学 (LC-MS)测序分析

测试方法 LC-MS(QE/HF-X).鉴定通量（***种左右），主要包含（能量代谢类，氨基酸类，脂肪酸类，色氨酸类，多酚类，脂质类）等相关小分子物质。数据分析包括（pca分析，go分析，kegg分析，venn分析，火山图分析）

份

客户指定厂家

新增，以议标价格为准

***

靶向代谢测定

采用 LC-MS、ICS、HPLC、GC-MS等方法测序样品中代谢物质。可以检测的代谢物质种类包括： 氨基酸、维生素、脂肪酸、有机酸、类胡萝卜素、花生四烯酸、糖代谢、类黄酮、生物碱、TCA胆汁酸、生物胺、神经递质、TMAO、植物激素、单宁类、多酚类、花青素、糖等。

样

客户指定厂家

新增，以议标价格为准